Plant Ecosystem Conservation
حفاظت زیست بوم گیاهان
PEC
Agriculture
http://pec.gonbad.ac.ir
1
admin
2476-3462
10
8
10.22034/pec
14
8888
13
fa
jalali
1398
11
1
gregorian
2020
2
1
7
15
online
1
fulltext
fa
تنوع ژنتیکی گیاه بیابانی رمس (Haloxylon salicornicum (Moq.) Bunge ex Boiss)، در رویشگاههای مختلف با استفاده از نشانگر ISSR (مطالعه موردی: استان یزد)
Genetic diversity of Haloxylon salicornicum (Moq.) Bunge ex Boiss in Different habitats using ISSR Markers (Case study: Yazd)
تخصصي
Special
پژوهشي
Research
<strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">گیاه رمس (</span></span></span></strong><strong><em><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">Haloxylon</span></span></span></span></em></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;"> <em>salicornicum</em> (Moq.) Bunge ex Boiss</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">) گونه</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">ای درختچه</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">ای است که در بخش</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;"></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">های وسیعی از مناطق مرکزی ایران رویش دارد. سازگاری بالای این گونه به شرایط سخت محیطی و اهمیت آن در تثبیت شن، کنترل ریز گردها و کارکردهای دارویی، ایجاب می</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">نماید تا با شناخت تنوع ژنتیکی آن، نسبت به انتخاب ژنوتیپ</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">های برتر اقدام نمود. در این مطالعه تعداد 12 آغازگر مربوط به نشانگر داخلی ریز ماهوارهها برای ارزیابی تنوع ژنتیکی 30 ژنوتیپ رمس از سه منطقه جغرافیایی استان یزد استفاده شد. از بین 12 آغازگر تنها 4 آغازگر قادر به تکثیر 39 مکان ژنی با تولید باندهای واضح شدند که تعداد 32 باند، چند شکلی (5/79%) نشان دادند. متوسط میانگین مقادیر ضریب تنوع</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">پذیری نی و شانون به</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">ترتیب 451/0 و 643/0 تعیین گردید. آغازگرهای </span></span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">ISSR826</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> با 15 آلل وآغازگر </span></span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">SSR17</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> با 7 آلل باند به</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">ترتیب بیشترین و کمترین مکان ژنی را تولید نمودند. تعداد آلل</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">ها در هر جایگاه از 7 تا 15 آلل متغیر بود و با میانگین 9/7 محاسبه گردید. با استفاده از آنالیز خوشهای بر مبنای ضریب الگوریتم </span></span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">UPGMA</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;"> و ضریب تشابه جاکارد، جدایهها با سطح تشابه 75% در 11 گروه قرار گرفتند. شاخص شانون، تجزیه و تحلیل مؤلفههای اصلی (</span></span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">PcoA</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">) و تجزیه واریانس مولکولی (</span></span></span></strong><strong><span dir="LTR"><span style="color:black;"><span style="font-family:times new roman,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">AMOVA</span></span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">) تفاوت معنی­داری بین جدارههای سه منطقه مشاهده شد. تجزیه واریانس مولکولی نشان داد بالاترین مقدار تنوع ژنتیکی (81%) در بین جدایه</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">ها توزیع شده بود و تنوع ژنتیکی درون جدایه</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">های مختلف 19 درصد تعیین گردید. بر پایه نتایج به دست آمده چنین اثبات می</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">شود که تنوع ژنتیکی بالای درون جمعیت</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">ها می</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">تواند به</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:cambria,serif;"><span style="font-size:10.0pt;">­</span></span></span></strong><strong><span style="color:black;"><span style="font-family:nazanin;"><span style="font-size:10.0pt;">علت توزیع بسیار نزدیک جوامع رمس در نواحی مورد مطالعه باشد.</span></span></span></strong><br>
<br>
<pre>
<em>Haloxylon salicornicum</em> (Moq.) Bunge ex Boiss is a shrub that grows in large parts of the central regions of Iran. Due to the high adaptability of this species to the extreme environmental conditions and its role in sand dunes stabilization, dust control as well as its medicinal functions, recognition of its genetic diversity and the selection of superior genotypes is very important. In this study, a set of 12 Inter- simple sequence repeat (ISSR) markers were used to evaluate genetic variation of 30 genotypes from 3 locations in Yazd province. Between 12 primers, only 4 primers were able to produce 39 reproducible bands among which 32 bands were polymorphic (79.5%). The mean rate of Nei’s gene diversity (h') and Shannon’s diversity index (I) were 0.451 and 0.643, respectively. Primers ISSR 826 and ISSR7 with 9 and 7 alleles showed the highest and lowest number of loci, respectively. The number of alleles in each individual locus varied within a range of 7-15 with the mean of 9.75. Using cluster analysis based on UPGMA algorithm and Jaccard's similarity coefficient, the isolates with similarity level of 45% were divided into 5 groups. Shanon index, Principal Coordinates Analysis (PCoA), and Analysis of Molecular Variance (AMOVA) revealed a significant difference among isolates selected from three regions. Analysis of Molecular Variance showed that the highest genetic diversity rate (89%) was disturbed between isolates and genetic variation within different isolated was determined as 11%. Based on the results, it can be demonstrated that a high genetic diversity within the populations will exist due to the closely distributed Haloxylon community in these studied regions.<span dir="RTL"></span>
</pre>
بافق, تنوع ژنتیکی, رمس (Haloxylon salicornicum (Moq.) Bunge ex Boiss), نشانگر ISSR
Bafgh, Genetic diversity, (Haloxylon salicornicum (Moq.) Bunge ex Boiss, ISSR marker
217
235
http://pec.gonbad.ac.ir/browse.php?a_code=A-10-522-1&slc_lang=fa&sid=1
Mahdiyeh
Tajamoliyan
مهدیه
تجملیان
tajamoliyan@gmail.com
10031947532846006880
10031947532846006880
Yes
Yazd University
دانشگاه یزد
Hamid
sodqaeizadeh
حمید
سودائی زاده
hsodaie@yazd.ac.ir
10031947532846006881
10031947532846006881
No
Yazd University
دانشگاه یزد
kazem
sabagh
کاظم
صباغ
sksabbagh@yazd.ac.ir
10031947532846006882
10031947532846006882
No
Yazd University
دانشگاه یزد
Asghar
mosleharani,
اصغر
مصلح آرانی
amosleh@yazd.ac.ir
10031947532846006883
10031947532846006883
No
Yazd University
دانشگاه یزد
Mohammad hadi
Rad
محمد هادی
راد
mohammadhadirad@gmail.com
10031947532846006884
10031947532846006884
No
Yazd University
دانشگاه یزد
Mohhamad Ali
hakimzadeh
محمدعلی
حکیم زاده
hakim@yazd.ac.ir
10031947532846006885
10031947532846006885
No
Yazd University
دانشگاه یزد